Ke hoʻopilikia nei ʻo Tomato Brown Rugose Fruit Virus i nā mea kanu ʻōmato a me ka pepa ma ka honua holoʻokoʻa, ke hana nei nā ʻoihana hua i ka hoʻohua ʻana i kahi tōmato kūpaʻa.
Loaʻa nā kumu waiwai genetic a me genomic i nā mea hoʻohua tōmato ma mua o ka hoʻomaka ʻana o nā papahana hoʻonohonoho genomic o ka ʻōmato. Ua hoʻokumu ʻia nā hōʻiliʻili germplasm nui ma nā wahi he nui. ʻOi aku ma mua o 75,000 mau ʻāpana tōmato i mālama ʻia ma nā waihona genea a puni ka honua. ʻO kekahi o nā mea nui loa ʻo ka USDA genebank ma Geneva, NY.
Ua hoʻomaka ʻia ka hoʻonohonoho ʻana o ka genome tomato ma 2005 ma ke ʻano he hana multinational ma waena o 14 mau ʻāina a hoʻopau ʻia i ka makahiki 2012. Ua hoʻoikaika nui ʻia kēia mau hana me ka hoʻohana ʻana i ka naʻauao artificial, ke aʻo ʻana i ka mīkini a me nā algorithm kiʻekiʻe e nānā i ka nui o ka ʻikepili genetic a me ka phenotypic.
ʻO Tomato Pan-Genome
Ua hana nā mea noiʻi mai ka Boyce Thompson Institute i ka makahiki 2020 i kahi genome reference kiʻekiʻe no nā tōmato hihiu e hana i kahi pan-genome tomato piha a pono. Ua ʻike lākou i nā ʻāpana o ka genome e pili ana i ka ʻono o ka hua, ka nui a me ka oʻo ʻana, ka hoʻomanawanui ʻana i ke kaumaha a me ka pale ʻana i nā maʻi. Mahalo i kekahi hapa i nā ʻenehana sequencing ʻokiʻoki i hiki ke heluhelu i nā ʻāpana lōʻihi loa o ka DNA, ʻoi aku ka piha a me ka pololei o ka genome kuhikuhi ma mua o ka ʻikepili i loaʻa.
ʻO nā ʻenehana kaʻina hana kahiko e heluhelu ana i nā ʻāpana pōkole o ka DNA e ʻike i nā hoʻololi ʻana ma ka pae hoʻokahi. Eia naʻe, ʻaʻole maikaʻi lākou i ka ʻimi ʻana i nā ʻano like ʻole e like me ka hoʻokomo ʻana, ka holoi ʻana, ka hoʻohuli ʻana a i ʻole ke kope ʻana o nā ʻāpana nui o DNA.
I ka makahiki 2019, ua kūkulu kahi hui o ka poʻe noiʻi i kahi pan-genome tomato me ka hoʻohana ʻana i nā kaʻina genome mai 725 mau ʻano phylogenetically a me nā ʻano kikoʻī. Aia i loko o kēia waihona he 4,873 genes ʻaʻole i loaʻa i ka genome kuhikuhi kumu. Ua hōʻike ʻia nā loiloi hoʻololi i kēia manawa/ʻaʻole i ka nui o ka nalo ʻana a me ke koho maikaʻi ʻole o nā genes a me nā mea hoʻolaha i ka wā o ka hoʻoulu ʻana a me ka hoʻomaikaʻi ʻana.
E heluhelu i ka ʻatikala piha ma www.seedworld.com.